用标准的X光衍射技术测定DNA复合物的空间结构

用标准的X光衍射技术测定DNA复合物的空间结构

  Cro蛋白的空间结构已经用标准的X光衍射技术进行了测定。  Cro蛋白质分子含水晶体的分析表明，蛋白质呈二度对称排列在溶液中Cro有时以二聚体状态存在，在一起的两个 单体很可能具有晶体中分子所具有的同样对称性，这个观察具有特殊的意义，因为与Cro结合的DNA顺序也具有某种对称性，蛋白质的这种对称排列是与接近对称排列的碱基顺序结合的合理基础。
  进一步观察复合物可以发现，在每个Cro单体中，氨基酸处在能与DNA碱基形成氢键的位置，这提供了结合的专一性，这些氨基酸的位置还使它们与磷酸基团发生相互作用，从而提供了结合的强度。  因此Cro-DNA复合物只是结构已知的顺序专一性复合物中的一种，要作出一般性结论似乎还为时过早，但是，对于所有在特定碱基顺序内发生的结合的DNA-蛋白质复合物来说，有几个特征可能是共同的，被特定手蛋白质所识别的大部分DNA碱基顺序具有一定程度的对称性，而且，许多顺序专一的DNA结合蛋白都是多亚基的蛋白质，因此可以预期，蛋白质往往形成对称性排列，这样有利于识别对称性顺序，还分析了其他几种专一性或非专一性的DNA结合蛋白，初步证据表明，在这些蛋白质的表面往往存在两个或三个伸展的螺旋区域，因为每个Cro单体的一个螺旋伸进DNA的大沟中，这在很大程度上决定着发生结合的相互作用，所以认为螺旋插入大沟可能也是DNA-蛋白质相互作用的一般特征，在讨论组蛋白与染色质的结合时也曾提出过这样的相互作用。