基因组测序,基因组DNA首先都要通过酶切成片段

基因组测序，基因组DNA首先都要通过酶切成片段
通过基因组序列可以知道一个完整基因组结构。然而一个基因组有几百万的碱基序列，因此要解决这一问题就需要应用微生物学，统计学，生物信息学等多种方法。    基因组测序有两种方法，基因组DNA首先都要通过酶(限制性内切酶)或物理方法(如超声波)切成片段。    方法一：分级归类测序，测序前分级归类，每类都由分类的基因组片段组成。    方法二：也叫全基因组鸟枪法，是跳过最初的归类分组实验阶段，而直接测序任意组的DNA片段，然后通过生物信息学方法，针对这些DNA片段之间共同的重叠序列，来拼接并重新排出各个已测序的DNA片段在基因组中的位序。方法一：分级归类测序    提取DNA后，将其切成片段，一般通过超声波法，切成可操作的单元(如：用大的载体可以被克隆的片段)50～200 kb，在载体中将其克隆，如细菌人工染色体(BACs，见图解8)；克隆的数量一定要大，即达到总基因量的5～10倍。这些克隆的基因组片段然后通过特定探针(分子标记)杂交或限制性内切图谱分析或BAC末端(500～600 bp)杂交和测序后排序，在这些克隆片段(基因组片段)被排序后，选取单个克隆再打断成短的，可测序片段，然后由统计学方法来拼接和排列成基因组序列(比对排列)。